El Museu de la Pesca vol contribuir, com a element de qualitat, al desenvolupament cultural, econòmic i social de la comunitat. Treballa per afermar-se al propi territori i ajudar a provocar canvis i reflexions envers el patrimoni marítim i pesquer que afavoreixin la societat. Els objectius que l’han d’ajudar a tirar endavant aquests propòsits giren entorn de les àrees de conservació, recerca, difusió i interpretació del mateix Museu:
- Garantir la conservació, la protecció i la salvaguarda de les col·leccions que integren el fons del Museu i del patrimoni marítim i pesquer de la Costa Brava.
- Impulsar la recerca sobre el fet marítim i pesquer.
- Facilitar la consulta i l’estudi del fons.
- Plantejar un discurs expositiu, que a través del patrimoni marítim i pesquer, contribueixi a la sensibilització cap a la sostenibilitat.
- Donar les claus d’interpretació de la realitat, econòmica, social i cultural del sector marítim.
- Convertir-se en un lloc de diàleg entre la gent de mar i la resta de la societat.
- Accentuar lal vocació marítima de Palamós
- Ser un referent, un element clau de les comunitats de la costa gironina.
- Mostrar el nostre passat marítim
- Plantejar els problemes i els reptes que el sector ha d’afrontar.
El Museu de la Pesca ofereix un programa pedagògic adreçat a escoles d’educació infantil, primària i secundària, així com activitats diverses –visita guiada a la subhasta del peix i al centre d’interpretació de la pesca, taller de cuina marinera, etc.– als visitants.